Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VEGFBP49765 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms