Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp4P35123 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp4P35123 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms