Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmgxb3G3X9M3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hmgxb3G3X9M3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms