Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv5A0A0B4J1G9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Trbv5A0A0B4J1G9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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