Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 FAM177A1P1-201ENST00000503598 473 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC85BQ15834 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms