Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms