Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
DKK3Q9UBP4 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms