Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms