Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
SEMA4CQ9C0C4 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SEMA4CQ9C0C4 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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