Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PAX6-209ENST00000419022 6888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms