Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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