Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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