Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PGGT1BP53609 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PGGT1BP53609 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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