Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CCDC38Q502W7 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CCDC38Q502W7 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CCDC38Q502W7 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC38Q502W7 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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