Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CCDC142Q17RM4 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CCDC142Q17RM4 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms