Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
NRF1Q16656 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms