Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNU12-2P-201ENST00000364789 156 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms