Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPS12P20-201ENST00000464109 380 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SMCO1Q147U7 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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