Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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