Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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IFT88Q13099 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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