Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms