Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LTBQ06643 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
LTBQ06643 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LTBQ06643 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBQ06643 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms