Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AL391869.1-201ENST00000414581 475 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CASQ1P31415 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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CASQ1P31415 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 AP005328.1-201ENST00000577719 681 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 KCNJ10-204ENST00000637644 1239 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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