Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXA13P31271 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms