Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLDN9O95484 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CLDN9O95484 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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