Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRTM2O43300 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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