Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 NINJ2-202ENST00000397265 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FTH1P10-201ENST00000401830 930 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TMEM211-202ENST00000423535 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP002383.1-201ENST00000439405 720 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ALDH7A1P2-201ENST00000456501 621 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LMCD1-AS1-207ENST00000458666 581 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC139491.4-201ENST00000504629 354 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC022296.1-201ENST00000512176 682 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC027779.1-201ENST00000530492 516 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GNPTAB-203ENST00000549165 373 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC027288.3-203ENST00000553165 448 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC111152.2-201ENST00000561392 485 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.121-201ENST00000578843 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC005379.1-201ENST00000585647 328 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008569.2-201ENST00000589702 889 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC011477.1-201ENST00000591884 544 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008878.1-202ENST00000599312 382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL627P-201ENST00000620534 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL391095.3-201ENST00000621084 720 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PCBP1-AS1-320ENST00000627918 1146 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RBMS2-207ENST00000552247 1471 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC018682.1-201ENST00000506009 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MBTPS2-201ENST00000365779 4457 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 KIAA1328-203ENST00000586501 1577 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HMHB1-201ENST00000289448 384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 APOL4-201ENST00000328429 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP194-201ENST00000364662 113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LDHAP4-201ENST00000397561 998 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms