Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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ITGB3BPQ13352 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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