Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
ERVV-2B6SEH9 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms