Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GDAP2Q9NXN4 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GDAP2Q9NXN4 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms