Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SGF29Q96ES7 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms