Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NDUFB9P2-201ENST00000431248 507 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL441963.1-201ENST00000435137 792 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL590094.1-203ENST00000435649 828 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF816-205ENST00000438970 491 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TPTE2P6-201ENST00000440905 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL589674.1-201ENST00000454401 222 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GH1-204ENST00000458650 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL10AP3-201ENST00000462503 651 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL737P-201ENST00000490246 282 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL679P-201ENST00000497096 304 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC108516.2-201ENST00000508163 349 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC012555.1-201ENST00000551650 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01405-204ENST00000553177 524 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LGALS9DP-201ENST00000580112 764 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RN7SL498P-201ENST00000583650 298 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC008555.4-201ENST00000605481 568 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL110115.2-201ENST00000611296 325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 GH1-206ENST00000617086 376 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.205-201ENST00000620071 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC018558.4-201ENST00000622153 281 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC00282-201ENST00000626362 654 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC007221.2-201ENST00000634367 948 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 LINC01358-208ENST00000634569 1030 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PXYLP1-204ENST00000504264 1773 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MBIP-201ENST00000318473 1586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 AC005906.2-215ENST00000639700 1408 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 MTMR8-201ENST00000374852 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 SNORA42.2-201ENST00000384771 134 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 IGLV8-61-201ENST00000390283 414 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ANKRD39Q53RE8 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms