Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP6Q3SY56 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP6Q3SY56 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.3 ms