Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NPM1P14-201ENST00000343743 866 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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