Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CTNNA2-203ENST00000402739 3684 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DAZ4-203ENST00000382432 2405 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DAZ2-205ENST00000382433 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TRIM48-201ENST00000417545 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC020951.1-201ENST00000624361 2271 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SUN5-201ENST00000356173 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Z68871.1-201ENST00000426528 1133 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC105942.1-202ENST00000438509 952 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PRMT8-203ENST00000452611 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP003774.3-201ENST00000457725 985 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL355076.1-201ENST00000484315 270 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01603-202ENST00000519557 712 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PPP1R1AP1-201ENST00000525622 425 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC123788.1-201ENST00000526922 783 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AP001973.1-201ENST00000530177 572 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MIR3663-201ENST00000583207 97 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 STX8P1-201ENST00000603161 355 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL590644.1-202ENST00000634972 590 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 PDPN-212ENST00000621990 2738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 MOSPD2-204ENST00000482354 1870 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SLFN13-210ENST00000534689 3058 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01660-204ENST00000619172 3572 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 KCNA2-215ENST00000640956 1584 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SLITRK3-202ENST00000475390 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC01929-201ENST00000589125 3067 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 NLRP14-201ENST00000299481 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC012409.5-201ENST00000624746 3424 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AL356432.2-201ENST00000407841 422 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RN7SKP89-201ENST00000410774 242 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC00385-201ENST00000435044 374 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 C4orf51-201ENST00000438731 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 LINC00265-202ENST00000448955 468 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
MKRN3Q13064 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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