Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 FBXO3-209ENST00000531080 1448 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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FOXD4Q12950 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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