Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 OR52D1-201ENST00000322641 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RN7SL518P-201ENST00000491887 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
FHL3Q13643 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms