Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
AP3B2Q13367 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
AP3B2Q13367 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms