Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms