Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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TCIRG1Q13488 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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TCIRG1Q13488 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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TCIRG1Q13488 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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TCIRG1Q13488 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TCIRG1Q13488 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
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