Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
GPS1Q13098 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
GPS1Q13098 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms