Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC091304.5-201ENST00000568969 158 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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