Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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SYCP1Q15431 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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SYCP1Q15431 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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SYCP1Q15431 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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