Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NEUROD1Q13562 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms