Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RNASEL-201ENST00000367559 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC010980.1-204ENST00000589724 585 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HOXA3O43365 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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