Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MRPL45P2-203ENST00000573318 473 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 FXYD6P1-201ENST00000604857 285 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 XAGE1B-205ENST00000518075 472 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
LRIG3Q6UXM1 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms