Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SP140Q13342 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC084026.1-201ENST00000522028 564 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SP140Q13342 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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