Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 GOLGA6L5P-203ENST00000559768 578 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC112719.2-201ENST00000501239 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 THOC1-201ENST00000261600 2087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC068733.1-202ENST00000531479 2456 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TCL6-201ENST00000352367 3398 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
LTBRP36941 WDR87-202ENST00000447313 9009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 DLG2-218ENST00000524982 2872 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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LTBRP36941 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
LTBRP36941 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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