Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRCP08575 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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PTPRCP08575 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTPRCP08575 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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