Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
CNGB1Q14028 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
CNGB1Q14028 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms